Тут уже писал про плагины, но нашел более интересный способ проставления тега canonical, причем бзо всяких плагинов.

Нужно подправить слегка тему, а именно файл header.php, поменяв стандартную строку на

<?php if ( is_singular() ) echo ‘<link rel=»canonical» href=»‘ . get_permalink() . ‘» />’; ?>

Вот так вот, все легко и просто. Додумался до этого вот этот камрад.